Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LHX3Q9UBR4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LHX3Q9UBR4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LHX3Q9UBR4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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