Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHPF2Q9P2E5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms