Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SH3BP4Q9P0V3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SH3BP4Q9P0V3 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SH3BP4Q9P0V3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4Q9P0V3 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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