Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CDK5RAP3Q96JB5 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5RAP3Q96JB5 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms