Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNFT2Q96EX2 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNFT2Q96EX2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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