Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF6Q58WW2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms