Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSTA3Q13630 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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