Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CLN3Q13286 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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