Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC173Q0VFZ6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms