Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBRQ0VD83 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms