Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN12Q05209 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms