Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDK16Q00536 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms