Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HOXC5Q00444 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms