Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKOR1P84550 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms