Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EPHB1P54762 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHB1P54762 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHB1P54762 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHB1P54762 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHB1P54762 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHB1P54762 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHB1P54762 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHB1P54762 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHB1P54762 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHB1P54762 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHB1P54762 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHB1P54762 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHB1P54762 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHB1P54762 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EPHB1P54762 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms