Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJA8P48165 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GJA8P48165 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms