Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ME1P48163 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ME1P48163 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ME1P48163 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ME1P48163 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ME1P48163 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ME1P48163 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ME1P48163 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ME1P48163 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms