Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTMAP06454 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTMAP06454 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTMAP06454 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTMAP06454 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTMAP06454 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTMAP06454 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTMAP06454 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTMAP06454 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTMAP06454 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTMAP06454 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTMAP06454 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTMAP06454 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTMAP06454 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTMAP06454 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTMAP06454 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTMAP06454 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTMAP06454 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms