Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms