Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UPP2O95045 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UPP2O95045 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPP2O95045 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPP2O95045 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPP2O95045 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPP2O95045 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPP2O95045 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UPP2O95045 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPP2O95045 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UPP2O95045 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPP2O95045 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPP2O95045 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UPP2O95045 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms