Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMF1-BGLAPU3KQ54 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMF1-BGLAPU3KQ54 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms