Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIAS3Q9Y6X2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms