Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC4A4Q9Y6R1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms