Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC1Q9Y5R8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms