Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNPO3Q9Y5L0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms