Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC42Q9Y546 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms