Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NRXN3Q9Y4C0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NRXN3Q9Y4C0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NRXN3Q9Y4C0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms