Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HCN4Q9Y3Q4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCN4Q9Y3Q4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCN4Q9Y3Q4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms