Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SF3B6Q9Y3B4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3B6Q9Y3B4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3B6Q9Y3B4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms