Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC4Q9Y296 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAPPC4Q9Y296 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC4Q9Y296 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms