Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNQ9UQP3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNNQ9UQP3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNQ9UQP3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms