Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPS5Q9UPZ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HPS5Q9UPZ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms