Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP22Q9UPT9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP22Q9UPT9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms