Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNPO2Q9UMS6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNPO2Q9UMS6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNPO2Q9UMS6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.8 ms