Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDC23Q9UJX2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms