Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SALL4Q9UJQ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms