Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATPIF1Q9UII2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATPIF1Q9UII2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATPIF1Q9UII2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms