Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPS1Q9UHF7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRPS1Q9UHF7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRPS1Q9UHF7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms