Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS5

GABBR1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR1Q9UBS5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GABBR1Q9UBS5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABBR1Q9UBS5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GABBR1Q9UBS5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABBR1Q9UBS5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABBR1Q9UBS5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABBR1Q9UBS5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GABBR1Q9UBS5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms