Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GALPQ9UBC7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALPQ9UBC7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms