Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HCN3Q9P1Z3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN3Q9P1Z3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms