Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCKIPSDQ9NZQ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCKIPSDQ9NZQ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms