Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDE1Q9NZC3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDE1Q9NZC3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDE1Q9NZC3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms