Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX43Q9NXZ2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX43Q9NXZ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX43Q9NXZ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms