Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ERVK13-1Q9NX77 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK13-1Q9NX77 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK13-1Q9NX77 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms