Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVT9

ARMC1, Armadillo repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC1Q9NVT9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARMC1Q9NVT9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARMC1Q9NVT9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms