Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IMP3Q9NV31 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms