Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCP11L1Q9NUJ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCP11L1Q9NUJ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms