Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GPCPD1Q9NPB8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GPCPD1Q9NPB8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPCPD1Q9NPB8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
GPCPD1Q9NPB8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GPCPD1Q9NPB8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPCPD1Q9NPB8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPCPD1Q9NPB8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GPCPD1Q9NPB8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GPCPD1Q9NPB8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms