Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB6Q9NP58 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB6Q9NP58 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB6Q9NP58 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms